Интернет-базы данных по веществам

Ниже представлено краткое описание ряда открытых Web-ресурсов, предназначенных для поиска сведений о структуре, методах синтеза, физико-химических свойствах различных веществ.

1. ChemSpider 

http://chemspider.com

Бесплатная база данных Королевского химического общества Великобритании, содержащая информацию о химических соединениях. Постоянно пополняющаяся база содержит информацию о структуре, свойствах, спектральную информацию более чем 35 млн. структур. Поиск информации о молекуле можно проводить по систематическому имени, синонимам, фирменному (торговому) названию, идентификаторам (кодам и номерам). Кроме того, возможен «поиск по химической структуре» (search by chemical structure). Этот вариант поиска реализуется тремя способами:

  • созданием запросов на основе неполных данных об описании молекулы;
  • построением структуры на Web-странице;
  • использованием загружаемых пользователем файлов форма- тов MOL, SDF, CDX или изображений структур в файлах фор- матов PNG, JPG, GIF

 

2. PubChem

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov

изображение

Открытая база данных веществ и химических соединений, которая существует с 2004 года и поддерживается Национальным центром биотехнологической информации США (NCBI), подразделением Национальной медицинской библиотеки США. В ней содержатся сведения о структуре, физико-химических свойствах, токсичности, биологической активности вещества. Приводятся источники информации, сведения о патентах, применении. С помощью ресурса PubChem поиск можно проводить по химической формуле, либо по названию вещества «простым» поиском, либо воспользовавшись вкладкой «структурный поиск» (Structure search).

Используя web-апплет PubChem Sketcher (см. рисунок), можно нарисовать структуру в терминах графических формул, при этом апплет автоматически сгенерирует коды Smiles, InChI, InChIKey и общую химическую формулу. Возможна и обратная процедура: по указанным выше кодам можно получить изображение молекулы.

Коды Smiles, InChI, InChIKey представляют собой линейные нотации, отображающие химическую структуру вещества в форме одномерной строки символов. Их удобно использовать, например, в текстовых базах данных, когда невозможно использовать структурную формулу, либо когда код достаточно простой для написания. Идентификация веществ по кодам InChI (International Chemical Identifier) и InChIKey предложена IUPAC.

 

3. ChemSynthesis

http://www.chemsynthesis.com

База данных о химических структурах с возможностью структурного поиска. Отличительной особенностью этой базы от двух рассмотренных выше является то, что в ней содержатся сведения о методике синтеза заданного химического вещества. База данных периодически обновляется и пополняется сведениями из авторитетных научных журналов. В базе ChemSynthesis реализовано несколько вариантов поиска. Простейший поиск можно провести:

  • по химическому названию;
  • по молекулярной формуле;
  • по названию журнала;
  • по идентификационным номерам (например, CAS, EINECS);
  • по кодам InChIKey или Smiles

 Номер EINECS (или EC #, ELINCS #) – номер, присвоенный веществу согласно Европейскому перечню существующих коммерческих химических веществ (European inventory of existing commercial chemical substances). Также в базе возможен текстовый поиск (Text Search) и структурный поиск. Текстовый поиск проводится по названию вещества, определенному набору кодов и номеров, по молекулярной формуле и молекулярному весу, по ссылке на источник, в котором приводятся сведения о методе синтеза. Структурный поиск осуществляется с помощью web-апплета, позволяющего нарисовать химическую структуру (см. рисунок). Апплет имеет меню с функциональными группами, что облегчает процесс рисования молекулы.

 

4. Chemical Abstracts Service

http://www.cas.org

Сайт химической реферативной службы содержащий более чем 103 миллиона идентификационных номеров (CAS или CAS Registry Number, CASRN, CAS RN, CAS Number, CAS#) веществ. Реферативная служба, начиная с 1957 года, присваивает уникальный номер всем веществам, когда-либо упомянутым в литературе. Ежедневно база пополняется 15 тыс. новыми номерами. Полный список всех номеров CAS содержится в платной базе CAS REGISTRY, однако в онлайновых справочных базах, печатных каталогах имеется большое количество идентификаторов CAS.

 

5. Common Chemistry

http://www.commonchemistry.org

Официальная выборка идентификационных номеров CASRN, размещенная Химической реферативной службой (Chemical Abstracts Service). В Common Chemistry содержится информация о химических веществах, которые не менее тысячи раз упоминались в CAS. Пример интерфейса системы показан на рисунке.

Печать