Интернет-базы данных по веществам
1. ChemSpider
Бесплатная база данных Королевского химического общества Великобритании, содержащая информацию о химических соединениях. Постоянно пополняющаяся база содержит информацию о структуре, свойствах, спектральную информацию более чем 35 млн. структур. Поиск информации о молекуле можно проводить по систематическому имени, синонимам, фирменному (торговому) названию, идентификаторам (кодам и номерам). Кроме того, возможен «поиск по химической структуре» (search by chemical structure). Этот вариант поиска реализуется тремя способами:
- созданием запросов на основе неполных данных об описании молекулы;
- построением структуры на Web-странице;
- использованием загружаемых пользователем файлов форма- тов MOL, SDF, CDX или изображений структур в файлах фор- матов PNG, JPG, GIF
2. PubChem
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov
Открытая база данных веществ и химических соединений, которая существует с 2004 года и поддерживается Национальным центром биотехнологической информации США (NCBI), подразделением Национальной медицинской библиотеки США. В ней содержатся сведения о структуре, физико-химических свойствах, токсичности, биологической активности вещества. Приводятся источники информации, сведения о патентах, применении. С помощью ресурса PubChem поиск можно проводить по химической формуле, либо по названию вещества «простым» поиском, либо воспользовавшись вкладкой «структурный поиск» (Structure search).
Используя web-апплет PubChem Sketcher (см. рисунок), можно нарисовать структуру в терминах графических формул, при этом апплет автоматически сгенерирует коды Smiles, InChI, InChIKey и общую химическую формулу. Возможна и обратная процедура: по указанным выше кодам можно получить изображение молекулы.
Коды Smiles, InChI, InChIKey представляют собой линейные нотации, отображающие химическую структуру вещества в форме одномерной строки символов. Их удобно использовать, например, в текстовых базах данных, когда невозможно использовать структурную формулу, либо когда код достаточно простой для написания. Идентификация веществ по кодам InChI (International Chemical Identifier) и InChIKey предложена IUPAC.
3. ChemSynthesis
База данных о химических структурах с возможностью структурного поиска. Отличительной особенностью этой базы от двух рассмотренных выше является то, что в ней содержатся сведения о методике синтеза заданного химического вещества. База данных периодически обновляется и пополняется сведениями из авторитетных научных журналов. В базе ChemSynthesis реализовано несколько вариантов поиска. Простейший поиск можно провести:
- по химическому названию;
- по молекулярной формуле;
- по названию журнала;
- по идентификационным номерам (например, CAS, EINECS);
- по кодам InChIKey или Smiles
Номер EINECS (или EC #, ELINCS #) – номер, присвоенный веществу согласно Европейскому перечню существующих коммерческих химических веществ (European inventory of existing commercial chemical substances). Также в базе возможен текстовый поиск (Text Search) и структурный поиск. Текстовый поиск проводится по названию вещества, определенному набору кодов и номеров, по молекулярной формуле и молекулярному весу, по ссылке на источник, в котором приводятся сведения о методе синтеза. Структурный поиск осуществляется с помощью web-апплета, позволяющего нарисовать химическую структуру (см. рисунок). Апплет имеет меню с функциональными группами, что облегчает процесс рисования молекулы.
4. Chemical Abstracts Service
Сайт химической реферативной службы содержащий более чем 103 миллиона идентификационных номеров (CAS или CAS Registry Number, CASRN, CAS RN, CAS Number, CAS#) веществ. Реферативная служба, начиная с 1957 года, присваивает уникальный номер всем веществам, когда-либо упомянутым в литературе. Ежедневно база пополняется 15 тыс. новыми номерами. Полный список всех номеров CAS содержится в платной базе CAS REGISTRY, однако в онлайновых справочных базах, печатных каталогах имеется большое количество идентификаторов CAS.
5. Common Chemistry
http://www.commonchemistry.org
Официальная выборка идентификационных номеров CASRN, размещенная Химической реферативной службой (Chemical Abstracts Service). В Common Chemistry содержится информация о химических веществах, которые не менее тысячи раз упоминались в CAS. Пример интерфейса системы показан на рисунке.
